22 июля 2018
АРХИВ
Поиском новых антибиотиков займется уникальная компьютерная программа
24 января 2018



Группа ученых из Центра алгоритмической биотехнологии Санкт-Петербургского госуниверситета под руководством Павла Певзнера вместе с ассистент-профессором Университета Карнеги-Меллон Хосейном Мохимани представила новый метод быстрого поиска новых антибиотиков. Как передает "Фармацевтический вестник", речь идет об алгоритме VarQuest. Он быстро сравнивает сразу две базы данных - химические структуры известных биологически активных природных соединений и физические замеры (масс-спектры) производимых микроорганизмами веществ.

Комментирует доцент СПбГУ, кандидат физико-математических наук Антон Коробейников: "В каждой базе данных десятки тысяч соединений, и наш алгоритм оперативно находит похожие пары. Обнаружив новое соединение, похожее на известное биологически активное вещество, его можно подвергнуть более детальной проверке. Есть предположение, что обнаруженное новое соединение будет эффективнее с фармакологической точки зрения, чем его более изученные аналоги, представленные в базе данных".

Алгоритм актуален как никогда, ведь с каждым днем остается все меньше работающих антибиотиков из-за развивающейся у патогенов лекарственной устойчивости. Сообщается, что в крупнейшей базе замеров природных соединений насчитывается более миллиарда масс-спектров. Эта база доступна на платформе GNPS. Теперь здесь же пользователи смогут оценить и алгоритм VarQuest.
facebook
">
LJ
ЧИТАЙТЕ ТАКЖЕ:

MedDaily – «МедДэйли» новости медицины // Проект объединенной редакции NEWSru.com

Воскресенье, 22 июля 2018 г. // Последняя новость 20 июля 2018 г. 18:37

Все права на материалы и новости, опубликованные на сайте «МедДэйли», охраняются в соответствии с законодательством РФ. Допускается цитирование без согласования с редакцией не более 50% от объема оригинального материала, с обязательной прямой гиперссылкой на страницу, с которой материал заимствован. Гиперссылка должна размещаться непосредственно в тексте, воспроизводящем оригинальный материал «МедДэйли», до или после цитируемого блока.

Pазмещение рекламы на сайте MedDaily.ru

Обратная связь  Подписка на новости (RSS)

© 2010-2018 MedDaily